sábado, 30 de julio de 2022

Animales transgénicos

 

Scnn1b-Ratones BALB/c transgénicos como modelo de infecciones por Pseudomonas aeruginosa de la fibrosis quística pulmonar


TIPO DE ANIMAL TRANGENICO:

Ratones BALB/c (Scnnb1) --- Sobreexpresión

METODOS DE OBTENCION:

  1. Se generaron ratones transgénicos con sobreexpresión específica de las vías respiratorias de Scnn1a, Scnn1b y Scnn1c por microinyección de ovocitos híbridos fertilizados con un elemento promotor de CCSP  y las regiones de Scnn1a, Scnn1b o Scnn1c  en un vector pTG148.
  2. Los primeros ratones  se cruzaron con ratones C3B6, produciendo ratones transgénicos Scnn1a, Scnn1b y Scnn1c. 
  3. Luego para comprobar el gen se realizo una PCR.

USOS

  1. Respuesta de las citoquinas
  2. Tiempo de eliminación de las P. aeruginosa 
  3. Observación de la características histológicas de los pulmones
  4. Respuesta inmune
  5. Observación de la evolución de la enfermedad
  6. "Posible tratamiento"
VENTAJAS
  1.  Entendimiento de la fibrosis quística.
  2. Posibles tratamientos en el futuro contra la Fibrosis Quística.
  3. Observar la evolución de la enfermedad con patógenos que potencien los síntomas.
  4. Observación del daño tisular que causa la Fibrosis Quística.
  5. Evolucion de la inmunidad (activación de citoquinas, interleucinas, macrófagos, etc)
DESVENTAJAS
  1. Los ratones no son buenos animales de experimentación  en la Fibrosis Quística.
  2. No se puede realizar una comparación relativa con el ser humano.
  3. El proceso para la obtención de ratones de laboratorio es muy laborioso.  
  4. Las glándulas mucosas y submucosas del raton tiene una conformación diferente
  5. Los ratones de laboratorio tiene un corto tiempo de vida para enfermedades que se necesita un estudio a largo plazo.
Bibliografia
1.Brao KJ, Wille BP, Lieberman J, Ernst RK, Shirtliff ME, Harro JM. Scnn1b-transgenic BALB/c mice as a model of Pseudomonas aeruginosa infections of the cystic fibrosis lung. Infect Immun [Internet]. 2020;88(9). Disponible en: http://dx.doi.org/10.1128/IAI.00237-20

domingo, 24 de julio de 2022

Ácidos Nucléicos recombinantes en la naturaleza: Selección de SNP mediada por frecuencia de uso de codones en el gen lasR de la fibrosis quística Aislados de Pseudomonas aeruginosa

 

Tema: Selección de SNP mediada por frecuencia de uso de codones en el gen lasR de la fibrosis quística Aislados de Pseudomonas aeruginosa

Objetivo: Comprender el mecanismo de adaptación de la Pseudomonas aeruginosa

Gen/secuencia: Gen LasR 

E.R: dnpI

E.L: --------------------------------------------------------

Vector: pUC18T-mini-Tn7T-Gm / Subclonacion: pTNS2

C.R: Cepa P. aeruginosa wildtype PAO1 / Cepa mutante derivada ΔlasR

MIG: Transformación (electroporación) 

MIC: Cultivo, Secuenciación sanger.

BIBLIOGRAFIA

1.Qiu H, Li Y, Dai W. Codon-usage frequency mediated SNPs selection in lasR gene of cystic fibrosis Pseudomonas aeruginosa isolates. Microbiol Res [Internet]. 2019;223–225:137–43. Disponible en: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0944501319302782

ADN recombinante  artificial: El ARNm modificado químicamente suministrado por nanopartículas lipídicas restaura la secreción de cloruro en la fibrosis quística


La terapia de ARNm a través de la administración de nanopartículas podría llegar a ser una terapia en contra de la fibrosis quística debido a que en los experimentos realizados en ratones knockuot se ha observado que  restauro el transporte de cloruro al epitelio de las vías respiratorias nasales sin embargo el ARNm modificado químicamente puede ser detectado y destruido por las nucleasas séricas y puede desencadenar una respuesta inmune en el individuo generando mas complicaciones.

BIBLIOGRAFIA

1.Robinson E, MacDonald KD, Slaughter K, McKinney M, Patel S, Sun C, et al. Lipid nanoparticle-delivered chemically modified mRNA restores chloride secretion in cystic fibrosis. Mol Ther [Internet]. 2018;26(8):2034–46. Disponible en: http://www.cell.com/article/S152500161830217X/abstract

sábado, 16 de julio de 2022

Análisis de microarrays cromosómicos, incluidas las aplicaciones constitucionales y de enfermedades neoplásicas,

 

Análisis de microarrays cromosómicos, incluidas las aplicaciones constitucionales y de enfermedades neoplásicas, revisión de 2021: un estándar técnico del Colegio Americano de Genética Médica y Genómica (ACMG)






Los microarrays y las técnicas de hibridación como FISH han sido aplicados en la evaluación diagnostica de anomalías cromosómicas relacionas a muchas neoplasias, según el  Colegio Americano de Genética Médica y Genómica (ACMG) y Colegio Americano de Obstetras y Ginecólogos (ACOG) recomiendan el uso de las plataformas de microarrays cromosómicos como prueba  de primer nivel en fetos que hayan sido diagnosticados  con anomalías por ultrasonografía. Esta técnica se debe realizar por laboratorios certificados debido a que su interpretación es muy difícil y compleja

Bibliografia 

  

1.Shao L, Akkari Y, Cooley LD, Miller DT, Seifert BA, Wolff DJ, et al. Chromosomal microarray analysis, including constitutional and neoplastic disease applications, 2021 revision: a technical standard of the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG). Genet Med [Internet]. 2021;23(10):1818–29. Disponible en: http://www.gimjournal.org/article/S1098360021051285/abstract 

domingo, 10 de julio de 2022

Diagnóstico combinado de QF-PCR y CNV-Seq en anomalías cromosómicas fetales: una nueva perspectiva sobre el diagnóstico prenatal

 

Diagnóstico combinado de QF-PCR y CNV-Seq en anomalías cromosómicas fetales: una nueva perspectiva sobre el diagnóstico prenatal



La QF-PCR es un método rápido para detectar el número de copias de uno o varios cromosomas en el liquido amniótico que brinda información sobre las anomalías cromosómicas.(1)

Desnaturalización: Se toma 1.9 ml de liquido amniótico, se utiliza un kit de extracción de ácido nucleico con método de perla magnética  para extraer el ADN genómico del líquido amniótico, la muestra se debe almacenar a -20 ° C. (1)

Hibridación y extensión: Se detecta y analiza las muestras, después de la amplificación, tomamos 1 μl del producto de PCR y mezclamos 13,5 μl de formamida y 0,5 μl de Liz600, para el análisis de datos.(1)

El análisis con  CNV-Seq  (variaciones en el numero de ADN) se encontraron  varias anomalías entre ella están: 2.8, deleciones, 1.2, disomía , trisomía en mosaico y monosomía en mosaico.(1)

Bibliografia

1.Qiao J, Yuan J, Hu W, Li Q, Fang H, Xu Y, et al. Combined diagnosis of QF-PCR and CNV-Seq in fetal chromosomal abnormalities: A new perspective on prenatal diagnosis. J Clin Lab Anal [Internet]. 2022;36(4):e24311. Disponible en: http://dx.doi.org/10.1002/jcla.24311



Un ejemplo de Técnica de Edición de Acidos Nucléicos en la fibrosis quistica: Reparación específica de alelos de mutaciones de empalme en fibrosis quística a través de la edición del genoma asCas12a

  Reparación específica de alelos de mutaciones de empalme en fibrosis quística a través de la edición del genoma asCas12a Tipo de Edición: ...